协议补偿股份是好事吗？
这种都是把双刃剑的事情，要看具体的情况来分析对公司是好还是坏！ 首先来看一个极端的例子，A上市公司和B股东签订协议，以一定价格（比如1元）收购其持有的C公司（A、B与C不存在关联关系）全部或部分股权。
如果C公司是一间空壳公司，没有任何资产和负债，那么对A来说是没有什么影响的，相当于花1元钱买了一袋子废纸；但如果C公司是一间有资产有负债的公司，并且A能以一定的价格收购C的资产负债表外的一切权利和义务，那么对A来说就相当于花1元钱买了一套带家具的房子——虽然房子不值这个价，但是里面东西值那么多钱。
不过这种情况显然是不现实的，所以实际上肯定要对收益和风险做出一些评估之后才能决定最终是否交易。 所以回到一开始的问题，需要判断这件事对上市公司好不好就要看这笔交易是不是做出了高于市场标准（即没有特殊事件的情况下）的溢价。从题主的描述来看，可能涉及到股权激励或者员工持股计划之类的，这种情况下可能是公司管理层认为在未来一段时间内这家公司能够获得高于行业平均水平的收益，所以愿意出高于市场标准的价购买这部分股票。
当然对于员工来说肯定是好事，减少了通过二级市场买入的成本，增加了实际收益；但是对于其他股东来说就不一定了，如果是这样的话。 因为不知道具体情况的方方面面，所以也不能给出明确的结论。